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时间 2024年5月10日 预览 38

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1、vcard文件文件用什么可以软件打开呢?

  vcard联系人名片文件,一般可以用记事本或者outlook打开。  vcard文件(后缀vcf)是手机导出的联系人名片文件,就是我们经常俗称的通讯录,使用该通讯录格式,对于我们复制、转移、编辑通讯录显得特别简易方便,通常我们都是用手机打开之后再编辑联系人!  

一、常见的vcf文件尤其是手机的vcf包含信息不多可以用记事本编辑。把文件拷贝到电脑,右键用记事本打开。  二.使用outlook,打开outlook,选择通讯簿。然后进入通讯簿管理  

1、把vcf文件拉到联系人联系人框,就会出现一个添加联系人的对话框,这里你可以浏览联系人信息,也可以修改添加信息。然后确定联系人就导入了。  

2、然后直接选定vcf文件,用鼠标把它们拉出来就行了。  三.使用操作系统自带的通讯录工具

  1. 电脑桌面左下角开始菜单,然后找到附件,在附件分类下找到通讯录

  2. 直接拖动你的vcard文件到通讯录中,这时通讯录中的名单和电话号码信息会一并导入到通讯录中

  3. 导入成功后你就可以在列表中看到通讯录中的名单了,可以双击查看详情,里面包含姓名、移动电话等其他信息。

2、Manta:一款方便临床测序使用的快速检测结构变异和INDEL 的软件

摘要: Manta软件可以从比对文件中检测SVs和indels。它主要开发用于检测单个样品的germline变异和tumor/normal配对样品的somatic变异。它可以在一套流程中高效的发现、组装、打分大范围的SVs,中型indels和大型insertions。该软件主要用于标准计算硬件上进行快速的分析:NA12878细胞系50x覆盖基因组可以在20核服务器上20分钟分析完毕,大多数WGS tumor/normal配对样品可以在2个小时内分析完毕。在SV的检测和打分过程中,Manta结合paired-read和split-read来提高准确性,但是在有其他有力证据的情况下,不需要利用split-read或者断点组装来报告融合。Manta通过连续组装的方法可以使分辨率达到碱基级别,更有利于下游的注释和临床意义分析。Manta软件接受输入BAM或CRAM格式文件,并以VCF4.1的格式报告所有的SV和indels突变。

引言: 目前许多前进的结构变异检测方法都集中在科学研究和群体基因组上。然而,目前还没有一个流程专注于快速检测单个或者成组样本的多种类型变异。Manta软件主要专注于临床领域,可以根据输入的比对文件和基因组文件,迅速对变异进行发现、组装、打分。它可以对二倍体的germline类型变异,tumor/normal配对的somatic变异进行检测,而RNA-Seq分析,de novo变异分析,不配对的tumor样品变异分析应用还在开发中。在与其他代表型的工具的比较中,Manta软件可以在显著降低计算成本的情况下,高质量的检测变异。

方法:

流程汇总 : Manta流程设计用于高并行的检测单个或成组的样品。它运行包括两个阶段:

1、首先建立基因组内所有断裂关联图表,

2、对图表中的组成部分进行处理,包括备选假设变异的生成、组装、打分以及VCF文件的报出。断点关联图表包括了任意基因组区域内远距离相关的边界,和indel组装区域的自边界。由于这个图表不含具体的假设变异,所以它非常的紧凑,可以在基因组范围内进行大片段的重构。在图表重构后,单独的边界(应该是相关的变异)用于后续变异的分析。每个边界都被分析,用于寻找不准确的假设变异,每个变异reads都会被组装并重新比对到基因组上。每个变异都会尝试进行组装,但是组装不是报告一个变异的必须步骤。在先前的germline和somatic变异模型下,所有paired-read和split-read的证据会被整合成一个质量分数,相应的过滤指标也会补充这个质量分数,以提高变异变异检测的精度。为了便于应用,Manta会自动评估插入片段的大小分布排除基因组中高重复区域。

变异检测评估: 在CEPH 谱系 1463上评估了变异软件的germline检出能力。为了获得一致的变异检出结果并提供软件之间的recall比较,选择了公认标准的软件进行变异检测并比较。选择Pindel用于检测indels,选择Delly用于检测SVs。每种检测软件检出的变异与Manta检测出的变异会建立pedigree变异一致数据集,用于软件的精度的比较,选择的数据集是NA12878细胞系。Delly软件也被当做是检测somtaitc变异的基准软件,比较了它与Manta在乳腺癌细胞系HCC1954上的检出能力。

? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?Recall =? ?召回率,评估的是灵敏度

? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?Precision =? ?准确率,评估的是特异性

结果: 表1 结果 从NA12878细胞系的SVs(大片段的缺失和重复)检测结果来看,Manta具有较高的召回率。从NA12878细胞系的Indels检测结果来看,相对于500bp一下的小的插入缺失,大的插入缺失Manta软件的召回率优势更为明显。从HCC1954观测到Manta软件在所有变异类型中都具有强盛的性能,并且所有类型中组装到basepair分辨率的比例都很高。

表2结果:通过运行时间或者内存度量,Manta软件在提供更多种类变异类型检测时,具有更低的计算消耗和计算时间。

Manta软件详尽的变异检测算法原理稍后补充

参考文献:

Xiaoyu C , Ole S T , Richard S , et al. Manta: rapid detection of structural variants and indels for germline and cancer sequencing applications[J]. Bioinformatics, 2016(8):1220-1222.

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3、超能一家人官宣撤档

超能一家人官宣撤档

  超能一家人官宣撤档,关于撤档的原因,《超能一家人》在致歉信中表示是因为后期制作工作量巨大,无法按期完成所有制作工作。此时才宣布撤档显得有些仓促。超能一家人官宣撤档。

  超能一家人官宣撤档1

  1月5日,影片《超能一家人》在官微发出致歉信,并附文表示:“感谢支持,择日再见。”而对外官宣撤档的理由,则是“后期制作工作量巨大,虽经努力但依然无法按期完成所有制作工作”。消息一出,立马引发网友热议,纷纷谴责官方给出的这个撤档理由过于牵强,不该甩锅给幕后工作者,甚至还有网友爆料称,该影片撤档的真实原因是没过二审。

  《超能一家人》是由宋阳执导,艾伦、沈腾、陶慧、张琪、韩彦博、白丽娜主演的喜剧电影,也是高兴麻花首部春节档喜剧电影,讲述了一段钞能力和钞能力相互较量的爆笑故事。而艾伦一家人的“超能力”,不仅是高兴麻花史上最大制作,也是麻花电影工业水准的再创新高,为给观众交上一份满意的答卷,剧组还远赴俄罗斯拍摄。《小老板|SERVICE》尊享免费大平台

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